¿Qué es un reordenamiento?



En un informe de patología molecular, la palabra reordenamiento Se refiere a un cambio en la estructura del ADN dentro de una célula. El ADN suele estar organizado en largas cadenas llamadas cromosomas, cada una de las cuales contiene muchos genes. Una reorganización ocurre cuando un fragmento de un cromosoma se desprende y se adhiere a otro lugar, ya sea en el mismo cromosoma o en otro cromosoma. Este cambio puede afectar el funcionamiento de los genes y, en ocasiones, contribuir al desarrollo del cáncer.

¿Por qué ocurren los reordenamientos?

Los reordenamientos pueden ocurrir por muchas razones. Algunos ocurren por casualidad cuando una célula comete un error al copiar su ADN. Otros son causados ​​por factores ambientales, como la exposición a la radiación o a sustancias químicas nocivas. A veces, las personas pueden heredar tendencias genéticas que hacen que sus células sean más propensas a los reordenamientos. Sin embargo, la mayoría de los reordenamientos que ocurren en el cáncer no son hereditarios, sino que se desarrollan con el tiempo en células específicas, conocidas como reordenamientos somáticos.

¿Qué le sucede a una célula después de que se produce un reordenamiento?

Cuando se produce una reorganización, puede alterar el funcionamiento de genes específicos. A veces, esto hace que un gen se vuelva más activo de lo que debería, mientras que otras veces puede silenciar un gen necesario para controlar la célula. Si la reorganización afecta a un gen que controla el crecimiento celular, la célula afectada puede dividirse sin control, lo que finalmente da lugar a un tumor. Sin embargo, no todas las reorganizaciones causan daño; algunas no afectan a la célula.

¿Cómo los reordenamientos causan cáncer?

Los reordenamientos pueden unir dos genes diferentes, creando un gen de fusiónEl gen de fusión puede producir una proteína anormal que promueve el crecimiento celular descontrolado. En otros casos, los reordenamientos pueden alterar los genes supresores de tumores que normalmente mantienen bajo control la división celular. Sin estos controles, la célula puede multiplicarse sin control y formar un tumor.

¿Los reordenamientos siempre causan cáncer?

No todos los reordenamientos conducen al cáncer. Muchos ocurren sin ningún impacto en el funcionamiento de las células. A veces se las denomina reorganización de pasajeros porque están presentes pero no afectan el crecimiento del tumor. Un reordenamiento puede contribuir al cáncer solo cuando Implica genes específicos que controlan el crecimiento y la división celular. Incluso en ese caso, la reorganización debe afectar a la célula de una manera que la ayude a crecer sin control.

¿Cómo realizan los patólogos las pruebas para detectar reordenamientos?

Los patólogos utilizan varias técnicas para detectar reordenamientos en las células tumorales:

  • Hibridación in situ con fluorescencia (FISH): Esta prueba utiliza sondas fluorescentes para detectar cambios específicos del ADN. ayuda a identificar reordenamientos más grandes o fusión eventos que involucran genes conocidos.
  • Reacción en cadena de la polimerasa (PCR): La PCR amplifica pequeños segmentos de ADN para detectar reordenamientos específicos conocidos, como aquellos que involucran genes de fusión.
  • Secuenciación de próxima generación (NGS): La NGS permite a los patólogos secuenciar grandes regiones de ADN para encontrar una amplia gama de reordenamientos, incluidos aquellos que son difíciles de detectar con otros métodos.
  • Cariotipo: Esta prueba examina la estructura de los cromosomas bajo un microscopio para identificar reordenamientos a gran escala. Se utiliza a menudo para estudiar cánceres de la sangre, como el leucemia.

Los resultados de estas pruebas indicarán si se encontraron reordenamientos y si es probable que afecten el tratamiento.

A continuación se muestra un ejemplo de cómo podría aparecer un resultado de reordenamiento en un informe de patología molecular:

Prueba: Hibridación fluorescente in situ (FISH)
Resultado: Positivo para ALK-EML4 fusión

Interpretación: La presencia de un ALK-EML4 Se detectó una fusión en las células tumorales. Este reordenamiento se observa comúnmente en cáncer de pulmón de células no pequeñas (CPCNP) y sugiere que el tumor puede responder bien a los inhibidores de ALK, como crizotinib o alectinib.

En este ejemplo, el informe confirma que las células cancerosas del paciente contienen el ALK-EML4 fusión, es decir parte de la ALK El gen del cromosoma 2 se ha fusionado con el EML4 gen. Esta fusión crea una proteína anormal que impulsa el crecimiento del cáncer. Un resultado positivo sugiere que las terapias dirigidas (medicamentos diseñados específicamente para bloquear la proteína ALK anormal) probablemente sean efectivas para tratar el tumor.

¿Cuáles son los reordenamientos genéticos más comunes y sus cánceres asociados?

A continuación se muestra una lista de reordenamientos genéticos comunes y los cánceres en los que se encuentran con frecuencia:

  • BCR-ABL1: Leucemia mieloide crónica y leucemia linfoblástica aguda
  • ETV6-RUNX1: Leucemia linfoblástica aguda
  • PML-RARA: Leucemia promielocítica aguda
  • ALK-EML4: Cáncer de pulmón de células no pequeñas
  • TMPRSS2-ERG: Cáncer de próstata
  • EWSR1-FLI1: Sarcoma de Ewing
  • CCND1-IGH: Linfoma de células del manto
  • BCL2-IGH: Linfoma folicular
  • BCL6-IGH: Linfoma difuso de células B grandes
  • NPM1-ALK: Linfoma anaplásico de células grandes
  • MYC-IGH: Linfoma de Burkitt
  • SS18-SSX1: Sarcoma sinovial
  • RET-PTC: Cáncer de tiroides
  • ROS1-CD74: Cáncer de pulmón de células no pequeñas
  • CBFB-MYH11: Leucemia mieloide aguda
  • EjecutarX1-EjecutarX1T1: Leucemia mieloide aguda
  • MLL-AF9: Leucemia mieloide aguda
  • EWSR1-ATF1: Sarcoma de células claras
  • TFE3-ASPSCR1: Sarcoma alveolar de partes blandas
  • FGFR3-TACC3: Cáncer de vejiga
  • NTRK1-TPM3: Cáncer de tiroides
  • NTRK3-ETV6: Carcinoma de mama secretor
  • KMT2A-ELL: Leucemia mieloide aguda
  • FGFR1-ZMYM2: Neoplasias mieloides/linfoides
  • PDGFRA-FIP1L1: Tumor del estroma gastrointestinal (GIST)
  • TBL1XR1-PLAG1: Carcinoma de glándulas salivales
  • PRKAR1A-RET: Cáncer de tiroides
  • BRAF-KIAA1549: Astrocitoma pilocítico
  • EWSR1-WT1: Tumor desmoplásico de células pequeñas y redondas
  • FOXO1-PAX3: Rabdomiosarcoma alveolar.
  • FGFR2-BICC1: Colangiocarcinoma
  • CDK4-MDM2: liposarcoma
  • NUP98-HOXA9: Leucemia mieloide aguda
  • ETV1-ELK4: Cáncer de próstata
  • TCF3-HLF: Leucemia linfoblástica aguda
  • ZRSR2-MLL: Leucemia mieloide aguda
  • PAX8-PPARγ: Cáncer de tiroides
  • BCOR-CCNB3: Sarcoma
  • CIC-DUX4: Sarcoma tipo Ewing
  • ERBB2-MLL: Cáncer de mama

Cada reordenamiento juega un papel importante en los cánceres en los que se encuentran. Su identificación confirma el diagnóstico y ayuda a los médicos a elegir terapias diseñadas específicamente para atacar estos cambios genéticos.

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