Mis on biomarker?

---

Biomarkerid on mõõdetavad muutused vähirakkudes, mis sageli hõlmavad spetsiifilisi geene või valke. Neid biomarkereid võib leida erinevates kehaosades, sealhulgas veres, normaalses koes või kasvajas endas. Biomarkerid pakuvad väärtuslikku teavet inimesel juba esineva vähi omaduste kohta või näitavad tema riski tulevikus vähi tekkeks. Arstid kasutavad neid biomarkereid kõige tõhusamate ravimeetodite kindlakstegemiseks, ravi kohandamiseks iga patsiendi jaoks ja mõnikord ennetavate meetmete võtmiseks vähiriski vähendamiseks.

Kuidas biomarkereid kasutatakse?

Biomarkeritel võib olla teie raviteekonnal kriitiline roll, alates esmasest riskihindamisest kuni diagnoosimise, ravi planeerimise ja kordumise jälgimiseni. Need testid võivad anda väärtuslikku teavet teie ravi eri etappides, aidates teil ja teie arstidel teha teadlikke otsuseid, mis on kohandatud teie konkreetsele seisundile. Nende biomarkerite kasutamise mõistmine aitab teil paremini orienteeruda oma ravis ja teie tervishoiumeeskonna sammudes teie vähi haldamisel.

Vähiriski hindamine

Biomarkeriteste, mis hindavad vähiriski, tehakse sageli isikutel, kelle perekonnas on esinenud vähki või kellel on teadaolevad vähiriski suurendavad geneetilised seisundid. Näiteks võib BRCA1 või BRCA2 mutatsioonide testi teha inimesel, kelle perekonnas on esinenud rinna- või munasarjavähki. Kui leitakse mutatsioon, võib see teave kaasa tuua suurenenud järelevalve, näiteks sagedasemad mammogrammid või MRI-skaneeringud või ennetavad meetmed, nagu profülaktiline operatsioon rinna- või munasarjakoe eemaldamiseks. Eesmärk on vähendada vähki haigestumise riski või tabada see varases, paremini ravitavas staadiumis.

Linastub

Biomarkerite sõeluuringud avastavad vähki selle varases staadiumis enne sümptomite ilmnemist. Tüüpiline näide on PSA (eesnäärmespetsiifiline antigeen) test, mida kasutatakse eesnäärmevähi sõeluuringuks meestel. Seda testi võidakse regulaarselt teha teatud vanusest vanematel meestel või neil, kellel on eesnäärmevähi riskifaktorid. Kõrgenenud PSA tase võib viia edasiste uuringuteni, näiteks biopsiani, et teha kindlaks, kas vähk on olemas. Varajane avastamine sõeluuringu abil võib viia varasema ravini, mis võib potentsiaalselt parandada tulemusi.

Diferentsiaalne diagnoos

Kui patsiendil on kasvaja, võivad biomarkeri testid aidata kindlaks teha vähi täpset tüüpi, eriti kui vähk on mikroskoobi all sarnane. Näiteks kui patsiendil on a lümfoom, immunohistokeemia võidakse tuvastada CD20, valk, mida ekspresseeritakse spetsiifiliste lümfoomirakkude pinnal. Tulemused aitavad eristada erinevat tüüpi lümfoomi, mis on ülioluline, sest muud tüübid võivad vajada erinevaid ravimeetodeid. Täpne diagnoos tagab, et patsient saab kõige sobivama ravi.

Haiguse prognoosi kindlaksmääramine

Biomarkeri testid võivad anda teavet vähi agressiivsuse ja selle tõenäolise tulemuse kohta. Näiteks a Ki-67 test, mis on rakkude proliferatsiooni marker, võidakse teha kasvajaproovist. Kõrge Ki-67 tase näitab, et vähirakud jagunevad kiiresti, mis viitab agressiivsemale kasvajale, millel on suurem leviku risk. See teave aitab arstidel kindlaks teha, kui intensiivselt tuleks vähki ravida, näiteks kas patsient võiks saada kasu agressiivsemast keemiaravist.

Spetsiifilisele ravile reageerimise ennustamine

Spetsiifilised biomarkertestid ennustavad, kui hästi vähk teatud ravile reageerib. Näiteks võidakse kopsuvähiga patsiendil testida EGFR-geeni mutatsioone. Kui leitakse EGFR-mutatsioon, võidakse patsienti ravida sihipäraste ravimeetoditega, näiteks erlotiniibiga, mis on spetsiaalselt loodud muteerunud valgu aktiivsuse pärssimiseks. See lähenemisviis võib olla tõhusam ja vähem toksiline kui traditsiooniline keemiaravi, kuna see sihtib vähirakke täpsemalt.

Haiguse kordumise jälgimine

Pärast patsiendi ravi lõppu saab biomarkerteste kasutada vähi kordumise tunnuste jälgimiseks. Näiteks munasarjavähi tõttu ravitaval patsiendil võidakse regulaarselt teha vereanalüüse CA-125 taseme mõõtmiseks, mis on valk, mille tase võib vähi olemasolul tõusta. Kui CA-125 tase hakkab tõusma, võib see viidata kasvaja kordumisele, mis ajendab edasisi uuringuid või ravistrateegia muutmist.

Metastaatilise haiguse jälgimine

Patsientidel, kellel on teadaolev vähk, aitavad biomarkertestid jälgida haiguse progresseerumist teistesse kehaosadesse. Näiteks kolorektaalvähiga patsientidel võidakse aja jooksul jälgida CEA (kartsinoembrüoonse antigeeni) taset. Kui CEA tase tõuseb, võib see viidata sellele, et vähk on levinud teistesse organitesse, näiteks maksa või kopsudesse. See teave aitab otsustada täiendavate pildiuuringute tegemise või raviplaani muutmise üle. metastaseerunud haigus.

Riski kihistumine

Biomarkeri testid aitavad patsiente ka riskirühmadesse liigitada, suunates raviotsuseid. Näiteks a PD-L1 Kopsuvähi korral võidakse teha ekspressioonitest. Patsiendid, kellel on kõrge PD-L1 ekspressioon, võivad tõenäolisemalt reageerida immunoteraapia ravimitele, näiteks pembrolisumabile. Patsiendi PD-L1 staatuse teadmine aitab arstidel otsustada, kas lisada immunoteraapia raviplaani, mis võib potentsiaalselt parandada patsiendi eduka ravi tulemusi.

Kas biomarkerid on samad, mis täppismeditsiin?

Biomarkerid ja täppismeditsiin on omavahel tihedalt seotud, kuid mitte samad. Täppismeditsiin on meetod, mille abil kohandatakse ravi iga patsiendi individuaalsetele omadustele, mis sageli hõlmab vähi biomarkerite kasutamist. Kuigi biomarkerid annavad vähi kohta spetsiifilist teavet, kasutab täppismeditsiin seda teavet raviplaani koostamiseks, mis on sellele patsiendile tõenäolisemalt efektiivne.

Kas kõik vähiraportid sisaldavad biomarkereid?

Kõik vähiaruanded ei sisalda teavet biomarkerite kohta. See, kas biomarkerid on teie aruandesse kaasatud, sõltub mitmest tegurist, sealhulgas teie vähi tüübist, haiguse staadiumist ja konkreetsest kaalutavast raviplaanist. Mõnel juhul, eriti varajases staadiumis vähkkasvajate või ainult operatsiooniga ravitavate vähkide puhul, ei pruugi biomarkerite testimine olla vajalik. Siiski võib biomarkerite testimine olla otsustava tähtsusega teiste vähivormide, eriti arenenumate või spetsiifiliste omadustega vähivormide raviotsuste tegemisel. Teie arst otsustab teie juhtumi põhjal, kas biomarkeri testimine on sobiv.

Kuidas biomarkeri testimist tehakse?

Biomarkerite tuvastamiseks on saadaval mitu testi, millest igaüks sobib konkreetse vähiliigi ja hinnatava biomarkeri jaoks. Teie puhul sõltub testi valik teie vähiliigist ja teabest, mida arst vajab ravi suunamiseks. Erinevate testimismeetodite mõistmine aitab teil paremini mõista, kuidas teie tervishoiumeeskond töötab kõige täpsema diagnoosi ja tõhusa raviplaani andmiseks.

Immunohistokeemia (IHC)

Immunohistokeemia on tehnika, mis kasutab koeproovides spetsiifiliste valkude tuvastamiseks antikehi. Väikest kasvajaproovi töödeldakse sihtvalguga seonduvate antikehadega ja värvimuutus näitab valgu olemasolu. See test valitakse sageli, kuna see võimaldab arstidel näha täpselt, kus valk koes asub, mis võib olla oluline teatud tüüpi vähi diagnoosimisel. Näiteks võib tuvastamiseks kasutada IHC-d östrogeeni retseptor (ER) ekspressioon rinnavähis, mis aitab kindlaks teha, kas kasvaja on ER-positiivne ja tõenäoliselt reageerib hormoonravile. Patoloogiaaruandes kirjeldatakse IHC-testi tulemusi tavaliselt positiivsete või negatiivsetena ning neile võib lisada protsendi, mis näitab valku ekspresseerivate rakkude osakaalu.

Fluorestsents in situ hübridisatsioon (FISH)

KALAD on tehnika, mis tuvastab rakkudes spetsiifilisi DNA järjestusi, kasutades nendele järjestustele seonduvaid fluorestseeruvaid sonde. Seda testi tehakse sageli geneetiliste kõrvalekallete, näiteks geenide amplifikatsioonide, deletsioonide või ümberkorralduste tuvastamiseks. Näiteks võib FISH-testi kasutada ALK-geeni ümberkorralduste tuvastamiseks kopsuvähis, aidates tuvastada patsiente, kes võiksid saada kasu sihipärastest ravimeetoditest, näiteks krizotiniib. FISH-test valitakse teiste testide asemel, kui on oluline geneetiliste muutuste täpne lokaliseerimine rakkudes. Patoloogiaaruannetes kirjeldatakse FISH-tulemusi sageli testitava geneetilise muutuse puhul positiivsetena või negatiivsetena.

Järgmise põlvkonna järjestus (NGS)

Järgmise põlvkonna järjestus (NGS) on võimas tehnika, mis analüüsib samaaegselt mitut geeni, tuvastades mutatsioone, deletsioone, insertsioone ja muid geneetilisi muutusi kogu genoomis. NGS valitakse sageli siis, kui on vaja kasvaja terviklikku geneetilist profiili, eriti vähi korral, kus võib olla kaasatud mitu geeni. Näiteks võidakse NGS teha kopsuvähi proovil, et samaaegselt tuvastada mutatsioone EGFR-is, KRAS-is ja teistes geenides. See terviklik lähenemisviis aitab suunata raviotsuseid, tuvastades kõik potentsiaalsed terapeutilised sihtmärgid. Patoloogiaaruannetes võivad NGS-i tulemused sisaldada tuvastatud mutatsioonide loetelu koos teabega nende võimaliku mõju kohta vähile ja saadaolevate ravivõimaluste kohta.

Polümeraasi ahelreaktsioon (PCR)

Polümeraasi ahelreaktsioon (PCR) on meetod, mis võimendab spetsiifilisi DNA järjestusi, muutes mutatsioonide või muude geneetiliste muutuste tuvastamise lihtsamaks. PCR-i kasutatakse sageli spetsiifiliste teadaolevate mutatsioonide, näiteks BRAF V600E mutatsiooni testimisel. melanoomPCR valitakse selle tundlikkuse ja võime tõttu tuvastada proovis väikeseid muteerunud DNA koguseid. Patoloogiaaruannetes esitatakse PCR tulemused tavaliselt positiivseks või negatiivseks konkreetse testitava mutatsiooni puhul.

Tsütogeneetika/karüotüpiseerimine

Tsütogeneetika, sealhulgas karüotüüpimine, on rakkude kromosoomide uurimine. Karüotüüpimine hõlmab kromosoomide värvimist ja mikroskoobi all uurimist, et tuvastada suuri muutusi, näiteks puuduvad või lisakromosoomid või struktuurilised kõrvalekalded, näiteks translokatsioonid. Seda testi kasutatakse sageli verevähi, näiteks leukeemia korral, kus kromosomaalsetel muutustel võivad olla olulised prognostilised ja terapeutilised tagajärjed. Näiteks Philadelphia kromosoomi esinemine kroonilise müeloidleukeemia (KML) korral võib viidata vajadusele sihipärase ravi järele selliste ravimitega nagu imatiniib. Patoloogiaaruannetes kirjeldatakse tsütogeneetilisi tulemusi tavaliselt tuvastatud spetsiifiliste kromosomaalsete kõrvalekallete abil, lisades üksikasjad selle kohta, kuidas need kõrvalekalded võivad mõjutada prognoosi või raviplaani.

Milliseid vähitüüpe testitakse biomarkerite suhtes?

Biomarkerite testimine on oluline paljude vähivormide diagnoosimisel ja ravimisel. Kuigi kõik vähivormid ei vaja biomarkerite testimist, on teatud vähivormid tõenäolisemalt seotud spetsiifiliste biomarkeritega, mis võivad anda väärtuslikku teavet haiguse käitumise ja ravile reageerimise kohta.

Järgnevalt on toodud näited vähitüüpidest, mille puhul biomarkeri testimist tavaliselt kliiniliste otsuste langetamiseks kasutatakse.

• RinnavähkRinnavähk on üks levinumaid vähiliike naistel. Rinnavähi puhul tavaliselt testitavad biomarkerid on järgmised: ER (östrogeeni retseptor), PR (progesterooni retseptor)ja mutatsioonid geenides BRCA1 ja BRCA2. Näiteks võivad ER-positiivse rinnavähiga patsiendid saada kasu hormoonravist, mis on suunatud östrogeeniretseptoritele.
• KopsuvähkKopsuvähk on vähiga seotud surmade peamine põhjus. Biomarkerid nagu EGFR-i mutatsioonid, ALK-i ümberkorraldused ja PD-L1 ekspressiooni testitakse tavaliselt kopsuvähi korral. Need biomarkerid aitavad suunata ravi sihipäraste ravimeetoditega, nagu erlotiniib EGFR-i mutatsioonide korral ja pembrolizumab kõrge PD-L1 ekspressiooni korral.
• PärasoolevähkKolorektaalne vähk on maailmas kolmas levinuim vähk. Kolorektaalse vähi puhul testitud biomarkerid hõlmavad järgmist KRIBI, NRAS, VENNA mutatsioonid ja mikrosatelliidi ebastabiilsus (MSI). Näiteks KRAS-i mutatsioonid võivad ennustada, kas vähk reageerib spetsiifilistele sihipärastele ravimeetoditele.
• MunasarjavähkMunasarjavähk diagnoositakse sageli juba kaugelearenenud staadiumis. Tavaliselt testitakse biomarkereid nagu CA-125 ning BRCA1 ja BRCA2 mutatsioone. Need biomarkerid aitavad suunata raviotsuseid ja jälgida kordumise võimalust.
• EesnäärmevähkEesnäärmevähk on meestel üks levinumaid vähivorme. PSA taset kontrollitakse rutiinselt eesnäärmevähi sõeluuringuks. Lisaks võivad BRCA1 ja BRCA2 geenide mutatsioonid anda teavet riski ja prognoos.
• Melanoom: Melanoom on agressiivne nahavähi tüüp. Biomarkerid nagu VENNA ja NRAS mutatsioone testitakse tavaliselt. BRAF-i mutatsioone, eriti mutatsiooni V600E, saab sihtida selliste ravimitega nagu vemurafeniib.
• Lümfoom: Lümfoom on immuunsüsteemi vähk. Lümfoomi puhul testitavate tavaliste biomarkerite hulka kuuluvad valguekspressioon (nt CD20, CD30ja BCL2) ja MYC geeni ümberkorraldused. Need biomarkerid aitavad määrata lümfoomi tüüpi ja suunata ravi.
• KilpnäärmevähkKilpnäärmevähk on üldiselt aeglaselt kasvav vähk, kuid mõned tüübid võivad olla agressiivsemad. Kilpnäärmevähi biomarkerid on järgmised: VENNA mutatsioonid, RET/PTC ümberkorraldused ja türeoglobuliinide tase. BRAF-i mutatsioone leidub tavaliselt näiteks papillaarne kilpnäärmevähk.
• Mao (mao) vähkMao vähk on oluline vähi suremuse põhjus. Mao vähi puhul testitud biomarkerid hõlmavad järgmist HER2 ekspressioon, mikrosatelliidi ebastabiilsus (MSI) ja PIK3CA mutatsioonid. HER2-positiivne maovähk võib reageerida sihipärasele ravile trastuzumabiga.
• kõhunäärmevähkPankreasevähk diagnoositakse sageli hilises staadiumis ja sellel on halb prognoos. Biomarkerid nagu KRIBI Tavaliselt testitakse mutatsioone, CDKN2A deletsioone ja SMAD4 kadu. Näiteks KRAS-i mutatsioonid esinevad paljudes kõhunäärmevähkides ja aitavad suunata raviotsuseid.
• Leukeemia: Leukeemia on verevähi rühm, mis mõjutab luuüdi ja verd. Leukeemia prognostilise või ennustava väärtusega biomarkerite hulka kuuluvad mutatsioonid FLT3, NPM1 ja TP53 geenides, samuti kromosomaalsed translokatsioonid, näiteks Philadelphia kromosoom kroonilise müeloidleukeemia (KML) korral. Need biomarkerid aitavad määrata leukeemia tüüpi, ennustada haiguse agressiivsust ja suunata ravi.
• Endomeetriumi vähkEndomeetriumi vähk on emaka vähi kõige levinum tüüp. Endomeetriumi vähi puhul tavaliselt testitavate biomarkerite hulka kuuluvad mikrosatelliidi ebastabiilsus (MSI), mutatsioonid PTEN ja PIK3CA geenides ning östrogeen ja progesterooni retseptori ekspressioon. Need biomarkerid võivad anda olulist teavet endomeetriumi vähi tüübi kohta ja suunata raviotsuseid.
• EmakakaelavähkEmakakaelavähk on sageli seotud infektsiooniga inimese papilloomiviirus (HPV). Emakakaelavähi puhul testitud biomarkerite hulka kuuluvad HPV staatus, p16 valgu ekspressioon ja PIK3CA mutatsioonid. HPV testimine aitab tuvastada kõrge riskiga viirustüüpe, mis on seotud emakakaelavähi tekke suurema tõenäosusega.
• Kesknärvisüsteemi (kesknärvisüsteemi) vähidKesknärvisüsteemi vähkide hulka kuuluvad mitmesugused kasvajad, mis esinevad ajus ja seljaajus. Kesknärvisüsteemi vähkide puhul tavaliselt testitavate biomarkerite hulka kuuluvad IDH1/2 mutatsioonid, 1p/19q kodeletsiooni staatus, MGMT promootori metülatsioon ja histoon H3 mutatsioonid. Need biomarkerid aitavad klassifitseerida kesknärvisüsteemi kasvajaid ja suunata ravistrateegiaid.
• Põievähk: Kusepõievähk on tavaline vähk, mis mõjutab kuseteede süsteemi. Põievähi puhul testitud biomarkerite hulka kuuluvad FGFR3 mutatsioonid, HER2 võimendus ja PD-L1 väljendus. Need biomarkerid võivad aidata ravi suunata, eriti kaugelearenenud või metastaseerunud haigus.
• Neeru vähkNeeruvähk tekib tavaliselt neerukoores. Neeruvähi puhul tavaliselt testitavate biomarkerite hulka kuuluvad mutatsioonid VHL, PBRM1 ja BAP1 geenides ning PD-L1 ekspressioon. Need biomarkerid aitavad ennustada ravivastust, sealhulgas immunoteraapiat.
• Seedetrakti strooma kasvaja (GIST)Seedetrakti stromaalkasvaja (GIST) on vähiliik, mis esineb seedetraktis, kõige sagedamini maos või peensooles. GIST-i biomarkerite testimine hõlmab sageli KIT-geeni mutatsioonide kontrollimist, mis esinevad enamikul juhtudel. KIT-mutatsioonide tuvastamine on oluline, sest see aitab suunata ravi sihipäraste ravimeetoditega, näiteks imatiniibiga, mis on spetsiaalselt loodud muteerunud KIT-geeni poolt toodetud ebanormaalse valgu pärssimiseks.

Levinud vähi biomarkerid

Vähi biomarkereid on tuhandeid ja iga päev avastatakse uusi. Aruandes olevad biomarkerid sõltuvad paljudest teguritest, sealhulgas teie haigusloost, teadaolevatest geneetilistest seisunditest ja tuvastatud vähi konkreetsest tüübist. Allpool on loetelu sagedamini testitud biomarkeritest ja sellest, mida nad võivad vähi kohta paljastada.

KRIBI

KRAS on geen, millel on oluline roll rakkude jagunemise reguleerimisel. Tavaliselt aitab KRAS rakkudel kontrollitult kasvada ja jaguneda. KRAS-i mutatsioonid võivad aga geeni pidevalt aktiivsena hoida, mis viib kontrollimatu rakkude kasvu ja vähi tekkeni. KRAS-i mutatsioonid on levinud kolorektaal-, kopsu- ja kõhunäärmevähi korral. KRAS-i mutatsioonide raviks on heaks kiidetud arvukalt sihipäraseid ravimeetodeid, näiteks sotorasiib ja adagrasib.

NRAS

NRAS on sarnane KRAS-iga ja osaleb rakkude kasvus ja jagunemises. Tavaliselt toimib NRAS rakkude kasvu ja jagunemise reguleerimiseks. NRAS-i mutatsioonid võivad aga põhjustada kontrollimatut rakkude kasvu, eriti melanoomi ja mõne verevähi korral. NRAS-i mutatsioonide jaoks on sihipäraseid ravimeetodeid piiratud, kuid tõhusate ravimeetodite väljatöötamiseks on käimas uuringud.

EGFR

EGFR on retseptorvalk, mis aitab rakkudel kasvada ja jaguneda. Normaalses olekus reguleerib EGFR rakkude kasvu. EGFR-i mutatsioonid võivad aga põhjustada rakkude kontrollimatut kasvu, mis põhjustab vähki. EGFR-i mutatsioone täheldatakse tavaliselt kopsuvähi korral ja nende mutatsioonidega vähi raviks kasutatakse selliseid sihipäraseid ravimeetodeid nagu erlotiniib ja gefitiniib.

ALK

ALK on geen, mis osaleb närvisüsteemi arengus. Tavaliselt aitab ALK reguleerida närvirakkude kasvu ja arengut. ALK geeni ümberkorraldused võivad aga põhjustada vähki, eriti kopsuvähki. ALK ümberkorraldustega vähi raviks on välja töötatud sihipärased ravimeetodid, näiteks krizotiniib ja alektiniib.

ROS1

ROS1 on retseptori türosiinkinaas, mis osaleb rakkude kasvus. Tavaliselt aitab ROS1 reguleerida rakkude kasvu ja ellujäämist. Kuid ROS1 geeni ümberkorraldused võivad põhjustada vähi arengut, eriti kopsuvähi korral. Sihtotstarbelised ravimeetodid, nagu krisotiniib, on tõhusad ROS1 ümberkorraldustega vähktõve ravis.

RET

RET on geen, mis osaleb rakkude signaaliülekandes ja kasvus. Tavaliselt aitab RET reguleerida mitmesuguseid rakuprotsesse, sealhulgas arengut ja diferentseerumist. RET-geeni mutatsioonid või ümberkorraldused võivad aga põhjustada vähki, eriti kilpnäärme- ja kopsuvähi korral. Sihipärased ravimeetodid, näiteks selperkatiniib ja pralsetiniib, ravivad RET-i muutustega vähki.

Kohtlemist

MET on retseptor-türosiinkinaas, mis mängib rolli rakkude kasvus ja ellujäämises. Normaalses olekus aitab MET rakkudel reageerida kasvusignaalidele. MET-i geenide amplifikatsioon või mutatsioonid võivad aga põhjustada vähki, eriti kopsu- ja neeruvähi korral. Sihtotstarbelised ravimeetodid, nagu krisotiniib ja kapmatiniib, ravivad MET-i muutustega vähki.

VENNA

BRAF on geen, mis osaleb rakkude sees kasvu soodustavate signaalide saatmises. Tavaliselt aitab BRAF reguleerida rakkude kasvu, edastades signaale raku pinnalt tuuma. BRAF-i mutatsioonid, eriti mutatsioon V600E, võivad aga põhjustada kontrollimatut rakkude kasvu ja vähki. BRAF-i mutatsioone täheldatakse tavaliselt melanoomi, kolorektaalse ja muude vähivormide korral. Sihtotstarbelised ravimeetodid, nagu vemurafeniib ja dabrafeniib, ravivad BRAF-i mutatsioonidega vähki.

Östrogeeni retseptor (ER)

Östrogeeniretseptor (ER) on valk, mis seondub östrogeeniga, aidates rakkudel kasvada. Tavaliselt reguleerib ER rakkude kasvu vastusena östrogeenile. ER-positiivse rinnavähi korral võib ER olemasolu aga soodustada vähi kasvu vastusena östrogeenile. Sihipärased ravimeetodid, näiteks tamoksifeen, blokeerivad östrogeeniretseptorit, takistades sellel vähi kasvu soodustamast.

Progesterooni retseptor (PR)

Progesterooni retseptor (PR) on valk, mis seob progesterooni ja osaleb rakkude kasvus. Tavaliselt aitab PR reguleerida rakkude kasvu vastusena progesteroonile. PR-positiivsete rinnavähkide korral võib PR-i esinemine aga põhjustada vähi kasvu vastusena progesteroonile. Hormonaalsed ravimeetodid, nagu tamoksifeen, mõjutavad ka PR-positiivseid vähktõbe, blokeerides hormooni retseptoreid.

HER2

HER2 on geen, mis kodeerib valku, mis osaleb rakkude kasvus ja paranemises. Tavaliselt aitab HER2 rakkudel kasvada ja end parandada. Kui aga HER2 geen amplifitseeritakse, põhjustab see HER2 valgu üleekspressiooni, mis põhjustab vähi kasvu. HER2 amplifikatsiooni täheldatakse sageli rinnavähi korral. Sihtotstarbelised ravimeetodid, nagu trastuzumab (Herceptin), ravivad HER2-positiivseid vähktõbe, blokeerides HER2 valgu.

BRCA1 ja BRCA2

BRCA1 ja BRCA2 on geenid, mis aitavad parandada DNA kahjustusi. Tavaliselt osalevad need geenid DNA parandamises ja geneetilise stabiilsuse säilitamises. BRCA1 või BRCA2 mutatsioonid võivad aga suurendada rinna-, munasarja- ja muude vähivormide riski. PARP inhibiitorid, nagu olapariib, on suunatud ravimeetodid BRCA mutatsioonidega vähi raviks, kasutades ära vähirakkude võimetust parandada DNA kahjustusi.

PIK3CA

PIK3CA on geen, mis osaleb rakkude kasvu ja ellujäämises. Tavaliselt mängib PIK3CA rolli signaaliradades, mis reguleerivad rakkude kasvu. PIK3CA mutatsioonid võivad aga põhjustada kontrollimatut rakkude kasvu ja vähki, eriti rinnavähki. PIK3CA mutatsioonidega vähi raviks kasutatakse sihipäraseid ravimeetodeid, näiteks alpelisiibi.

NTRK

NTRK geenid osalevad närvirakkude kasvus ning aitavad reguleerida nende kasvu ja arengut. NTRK geenidega seotud fusioonid võivad aga viia vähi tekkeni erinevates kudedes. Sihipärased ravimeetodid, näiteks sunitiniib, ravivad vähki tõhusalt NTRK geenide fusioonide abil.

IDH

IDH geenid kodeerivad ensüüme, mis osalevad raku ainevahetuses. Tavaliselt aitavad IDH ensüümid toitaineid raku energiaks muuta. IDH1 ja IDH2 mutatsioonid võivad aga viia ebanormaalsete metaboliitide tekkeni, mis aitavad kaasa vähi arengule, eriti glioomide ja mõnede verevähkide korral. Sihipäraseid ravimeetodeid, nagu ivosideniib ja enasideniib, kasutatakse IDH mutatsioonidega vähi raviks muteerunud ensüümi pärssimise teel.

FGFR

FGFR geenid kodeerivad valke, mis on seotud rakkude kasvu ja jagunemisega. Tavaliselt aitavad FGFR-valgud reguleerida erinevaid rakuprotsesse, sealhulgas rakkude kasvu ja diferentseerumist. Kuid mutatsioonid ja fusioonid FGFR geenides võivad põhjustada kontrollimatut rakkude kasvu ja vähki, eriti põievähi korral. FGFR-i muutustega vähkkasvajate raviks kasutatakse FGFR-i valgu aktiivsust inhibeerides sihipäraseid ravimeetodeid, nagu erdafitiniib.

PTEN

PTEN on kasvaja supressorgeen, mis aitab reguleerida rakkude kasvu, takistades rakkude kasvu ja jagunemist. See toimib rakkude kasvu pidurina, tagades, et rakud jagunevad ainult vajadusel. PTEN-i funktsiooni kadu võib aga selle regulatiivse kontrolli kaotada, mis viib kontrollimatu rakkude kasvu ja vähi tekkeni. PTEN-i kadu on täheldatud mitmesuguste vähivormide korral ja kuigi praegu puuduvad spetsiifilised PTEN-i kadu sihtravimid, võib selle olemasolu mõjutada raviotsuseid ja üldist lähenemisviisi vähi ravile.

KIT

KIT kodeerib retseptor-türosiinkinaasi, millel on oluline roll rakkude kasvus ja diferentseerumises. Tavaliselt aitab KIT reguleerida teatud rakutüüpide, sealhulgas seedetraktis esinevate rakkude arengut. KIT-geeni mutatsioonid võivad aga hoida seda pidevalt aktiivsena, mis viib kontrollimatu rakkude kasvu ja seedetrakti stromaaltuumorite (GIST-ide) tekkeni. Sihipärased ravimeetodid, näiteks imatiniib, ravivad KIT-mutatsioonidega GIST-e tõhusalt, pärssides ebanormaalset KIT-valku.

PD-L1

PD-L1 (programmeeritud surmaligand 1) on valk, mis mängib rolli immuunsüsteemi regulatsioonis. Tavaliselt aitab PD-L1 kaitsta terveid rakke immuunsüsteemi rünnaku eest. Vähi korral aga võib PD-L1 kõrge tase kasvajarakkudel aidata neil immuunsüsteemi eest põgeneda, lülitades välja T-rakkude rünnaku. Kõrge PD-L1 ekspressioon on sageli seotud parema immunoteraapia vastusega, kuna PD-L1 raja blokeerimine võib taastada immuunsüsteemi võime vähirakke sihtida ja hävitada. Ravimid nagu pembrolisumab ja nivolumab on suunatud PD-L1-le mitmesuguste vähivormide, sealhulgas kopsuvähi korral.

Mittesobivuse parandamine (MMR)

Mismatch Replikatsiooni (MMR) geenid parandavad DNA replikatsiooni käigus tekkivaid vigu. Tavaliselt aitavad MMR-geenid säilitada geneetilise materjali terviklikkust, parandades DNA vigu. Kuid MMR-i puudused võivad põhjustada mikrosatelliidi ebastabiilsust (MSI), mis on seotud teatud vähivormide, sealhulgas kolorektaalse vähi suurenenud riskiga. Immunoteraapia ravimeid, nagu pembrolizumabi, kasutatakse MSI-ga vähi raviks, suurendades immuunsüsteemi võimet vähirakke sihtida.

Kasvaja mutatsioonikoormus (TMB)

Tuumori mutatsioonikoormus (TMB) viitab mutatsioonide arvule kasvaja DNA-s. Kõrgem TMB näitab sageli, et kasvajal on palju geneetilisi muutusi, mis võivad muuta selle immuunsüsteemile paremini äratuntavaks. Kõrge TMB-ga kasvajad reageerivad tavaliselt immunoteraapiale paremini, kuna suurenenud mutatsioonide arv muudab immuunsüsteemil vähirakkude tuvastamise ja ründamise lihtsamaks. Immunoteraapiaid, nagu pembrolizumab, kasutatakse kõrge TMB-ga vähi raviks.