Translokatsioon



Translokatsioon on teatud tüüpi geneetiline muutus, mille käigus ühe kromosoomi tükk katkeb ja kinnitub teise kromosoomi külge. Kromosoomid on teie rakkude sees olevad struktuurid, mis kannavad DNA-d, mis sisaldab juhiseid, mida teie keha vajab kasvamiseks ja toimimiseks. Kui kromosoomitükid vahetavad kohti, loovad nad uusi geneetilise materjali kombinatsioone. Patoloogid mõnikord tuvastavad need muutused vähktõve või muude haigusseisundite diagnoosimisel.

Miks translokatsioonid toimuvad?

Translokatsioonid toimuvad siis, kui rakusisene DNA puruneb ja seejärel end valesti parandab, põhjustades kahe erineva kromosoomi osade liitumise. See võib juhtuda juhuslikult või olla põhjustatud sellistest teguritest nagu kokkupuude teatud kemikaalidega, kiirgus või mõnikord raku jagunemise käigus tekkinud vead. Enamik translokatsioone on juhuslikud sündmused, mis toimuvad aja jooksul ega ole vanematelt päritud.

Mis juhtub rakuga pärast translokatsiooni?

Kui translokatsioon toimub, võivad rakus olevad geneetilised juhised muutuda. Uus DNA kombinatsioon võib mõjutada konkreetsete geenide ekspressiooni, mis tähendab, et rakk võib käituda erinevalt. See võib mõnikord häirida raku normaalset funktsiooni, põhjustades selle kontrollimatut kasvu või jagunemist. Muul ajal ei pruugi translokatsioonil olla mingit mõju, olenevalt sellest, millised geenid on seotud.

Kuidas translokatsioonid põhjustavad vähki?

Rakkude kasvu või paranemist kontrollivaid geene mõjutavad translokatsioonid võivad põhjustada rakkude vähkkasvamist. Näiteks võib translokatsioon aktiveerida onkogeeni (geen, mis soodustab rakkude kasvu) või blokeerida kasvaja supressorgeeni (geen, mis aitab vältida kontrollimatut kasvu). See võib põhjustada vähktõbe nagu leukeemia, lümfoomvõi kartsinoom.

Kas translokatsioonid põhjustavad alati vähki?

Ei, mitte kõik translokatsioonid ei põhjusta vähki. Mõned translokatsioonid ei pruugi mõjutada mõjutatud geenide funktsiooni ja rakk võib jätkata normaalset toimimist. Neid nimetatakse healoomuline or vaikne translokatsioonid. Teised translokatsioonid võivad muuta geeni käitumist, kuid mitte piisavalt haiguse tekitamiseks. Patoloogid otsivad spetsiifilisi translokatsioone, mis põhjustavad vähi arengut, et aidata diagnoosida ja ravida.

Kuidas patoloogid translokatsioone testivad?

Patoloogid kasutage translokatsioonide tuvastamiseks spetsiaalseid teste, sealhulgas:

  1. Fluorestsents-in situ hübridisatsioon (FISH): FISH kasutab ümberkorralduste tuvastamiseks fluorestseeruvaid värvaineid, mis seostuvad kromosoomide teatud osadega.
  2. Polümeraasi ahelreaktsioon (PCR): PCR võimendab spetsiifilisi DNA järjestusi, et kontrollida teadaolevaid translokatsioone.
  3. Karüotüpiseerimine: See meetod hõlmab inimese kromosoomide täielikku kogumit mikroskoobi all, et tuvastada kõik ebanormaalsed muutused.
  4. Järgmise põlvkonna järjestus (NGS): See täiustatud test suudab tuvastada translokatsioone kogu genoomis, isegi kui need on liiga väikesed, et neid muude meetoditega näha.

Siin on näide translokatsiooni tulemusest molekulaarses aruandes:

Test: Fluorestsents-in situ hübridisatsioon (FISH)
Tulemus: Positiivne PML::RARA fusiooni korral

Suuline tõlge: Tuvastati sulandumine 15. kromosoomi PML geeni ja 17. kromosoomi RARA geeni vahel. See liitmine põhjustab ebanormaalse valgu tootmist, mis blokeerib normaalset vererakkude arengut ja soodustab leukeemiarakkude kasvu. PML::RARA sulandumine on iseloomulik ägedale promüelotsüütilisele leukeemiale (APL). Selle sulandumise tuvastamine kinnitab APL-i diagnoosi. See näitab, et patsient reageerib tõenäoliselt hästi sihipärasele ravile all-trans-retinoehappega (ATRA) ja arseentrioksiidiga (ATO).

Selles näites tuvastab aruanne PML::RARA fusiooni, translokatsiooni, mida tavaliselt seostatakse ägeda promüelotsüütilise leukeemiaga (APL). See sulandumine häirib vererakkude küpsemist ja soodustab leukeemiarakkude kontrollimatut kasvu. PML::RARA fusiooni tuvastamine juhendab arste valima väga tõhusaid ravimeetodeid, nagu ATRA ja ATO, mis on suunatud konkreetselt selle translokatsiooniga toodetud ebanormaalsele valgule.

Millised on levinumad geenide translokatsioonid?

Järgnev on loetelu tavalistest translokatsioonidest ja nendega seotud vähivormidest:

  • BCR::ABL1: krooniline müeloidleukeemia (CML), äge lümfoblastne leukeemia (ALL)
  • EWSR1::FLI1: Ewingi sarkoom
  • TMPRSS2::ERG: Eesnäärmevähk
  • ALK::EML4: mitteväikerakk-kopsuvähk (NSCLC)
  • PAX3::FOXO1: alveolaarne rabdomüosarkoom
  • NTRK1::TPM3: Kilpnäärmevähk, pehmete kudede sarkoom
  • SYT::SSX: sünoviaalne sarkoom
  • RET::CCDC6: papillaarne kilpnäärme kartsinoom
  • ETV6::NTRK3: Kaasasündinud fibrosarkoom, sekretoorne rinnakartsinoom
  • CBFB::MYH11: äge müeloidleukeemia (AML) inversiooniga 16
  • PML::RARA: äge promüelotsüütiline leukeemia (APL)
  • RUNX1::RUNX1T1: AML koos t(8;21)
  • CCND1::IGH: Mantelrakuline lümfoom
  • MYC::IGH: Burkitti lümfoom
  • BCL2::IGH: Follikulaarne lümfoom
  • BCL6::IGH: difuusne suur B-rakuline lümfoom (DLBCL)
  • MLL::AF4: KÕIK imik
  • MLL::AF9: AML koos t(9;11)
  • MLL::ELL: AML koos t(11;19)
  • EWSR1::ATF1: Selgerakuline sarkoom
  • EWSR1::WT1: Desmoplastiline väike ümarrakuline kasvaja
  • TCF3::PBX1: KÕIK koos t(1;19)
  • ETV6::RUNX1: Lapsepõlv KÕIK
  • PLAG1::CTNNB1: süljenäärme pleomorfne adenoom
  • EWSR1::NR4A3: müoepiteliaalne kartsinoom
  • NTRK3::ETV6: Infantiilne fibrosarkoom
  • ALK::NPM1Anaplastiline suurrakuline lümfoom (ALCL)
  • SS18::SSX1: sünoviaalne sarkoom
  • PRCC::TFE3: Xp11 translokatsiooniga neerurakk-kartsinoom
  • FUS::DDIT3: müksoidne liposarkoom
  • BRAF::KIAA1549: Pilotsüütiline astrotsütoom
  • FGFR3::TACC3: Glioblastoom, põievähk
  • EWSR1::POU5F1: Ekstraskeleti müksoidne kondrosarkoom
  • RARA::STAT5B: APL variant
  • EWSR1::PATZ1: primaarne intrakraniaalne sarkoom
  • TFE3::EI EI: Xp11 translokatsiooniga neerurakk-kartsinoom
  • CLTC::ALK: Põletikuline müofibroblastne kasvaja
  • TFEB::PRCC: Neerurakk-kartsinoom
  • CREB3L1::SS18: madala astme fibromüksoidne sarkoom
  • ZBTB16::RARA: APL variant

Igal translokatsioonil on oluline roll nendes vähkkasvajates, kus neid leidub. Nende tuvastamine kinnitab diagnoosi ja aitab arstidel valida ravimeetodeid, mis on spetsiaalselt loodud nende geneetiliste muutuste sihtimiseks.

A+ A A-