ATRX : Définition

ATRX qui veut dire alpha-thalassémie/retard mental lié à l'XLe gène ATRX fournit les instructions nécessaires à la production de la protéine ATRX, qui joue un rôle crucial dans l'encapsulation et la réparation de l'ADN dans nos cellules. Cette protéine permet de contrôler l'activation ou la désactivation des gènes, favorise la réparation de l'ADN et maintient les extrémités des chromosomes, appelées télomères.

ATRX est classé comme un gène suppresseur de tumeur, ce qui signifie qu'il aide normalement à prévenir le développement du cancer en régulant la croissance et la division cellulaires de manière contrôlée.

Que fait ATRX ?

La protéine ATRX a de nombreuses fonctions importantes à l’intérieur de la cellule :

• Remodelage de la chromatine : l'ADN est enrobé autour de protéines appelées histones pour former une structure appelée chromatine. L'ATRX contribue à réorganiser cette structure afin que les gènes puissent être activés ou désactivés au bon moment.
• Réparation de l’ADN : ATRX aide à réparer l’ADN cassé et facilite la récupération cellulaire lorsque l’ADN est endommagé.
• Entretien des télomères : ATRX aide à protéger les télomères, les capuchons situés aux extrémités des chromosomes qui maintiennent la stabilité de notre matériel génétique.
• Contrôle de l’expression des gènes : ATRX influence les gènes actifs ou silencieux dans différents types de cellules.

ATRX travaille en étroite collaboration avec une autre protéine appelée DAXX, et ensemble, ils aident à placer une version spéciale de la protéine histone (H3.3) dans des zones spécifiques de l'ADN, en particulier dans des régions répétitives ou étroitement emballées.

Quels types de cellules normales expriment ATRX ?

L'ATRX est présente dans presque toutes les cellules de l'organisme. Elle est particulièrement active dans les cellules à division rapide ou présentant un ADN complexe, comme les cellules cérébrales et les cellules en développement précoce des embryons. Dans le cerveau, elle joue un rôle majeur dans le développement normal.

Comment les pathologistes testent-ils l’ATRX ?

Pathologistes testent généralement l'ATRX en utilisant une méthode appelée immunohistochimieCe test utilise des anticorps spécifiques qui se fixent à la protéine ATRX dans un échantillon de tissu. Au microscope, les cellules présentant une expression normale d'ATRX présentent une coloration brun foncé. noyauIl s’agit d’un résultat positif, indiquant que la protéine ATRX est présente.

Si la protéine ATRX est absente en raison d'une mutation du gène ATRX, il n'y aura pas de coloration dans le noyau de la cellule tumorale. On parle alors de résultat négatif, suggérant qu'une mutation ou une autre altération affecte le gène ATRX. Il est important que les pathologistes recherchent une coloration positive dans les cellules normales environnantes (non tumorales) comme contrôle intégré pour garantir le bon fonctionnement du test.

Dans certains cas, notamment en cas de maladies héréditaires ou d'études de recherche, un test génétique peut être utilisé pour examiner directement la séquence d'ADN du gène ATRX. Ce test est souvent réalisé à l'aide de séquençage de nouvelle génération (NGS), qui lit le code du gène et peut détecter des mutations, des suppressions ou d'autres changements.

Quels types de tumeurs présentent des changements dans ATRX ?

L'ATRX est fréquemment altérée dans plusieurs types de tumeurs. Ces modifications résultent généralement d'une mutation entraînant la perte de la protéine ATRX dans les cellules tumorales.

• Gliomes – De nombreux gliomes de haut grade (tumeurs du cerveau et de la moelle épinière) adultes et pédiatriques présentent une perte d'expression d'ATRX. Ceci est particulièrement fréquent dans les astrocytomes et autres gliomes présentant des mutations du gène IDH.
• Tumeurs neuroendocrines pancréatiques – La perte d’ATRX est observée dans certaines tumeurs neuroendocrines pancréatiques et est associée à une instabilité chromosomique et à de moins bons résultats de survie.
• Tumeurs des muscles lisses utérins – Une perte d’ATRX a été identifiée dans certains types de léiomyosarcomes, un cancer rare de l’utérus.
• Syndrome myélodysplasique alpha-thalassémique acquis (SMAAT) – Il s'agit d'une maladie rare qui se développe chez les personnes atteintes de syndromes myélodysplasiques (un groupe de maladies de la moelle osseuse). Dans le SMAAT, des mutations somatiques du gène ATRX peuvent entraîner le développement d'une alpha-thalassémie, une maladie sanguine affectant la production d'hémoglobine.
• Phéochromocytome et paragangliome – Une perte d’ATRX est observée dans certaines de ces tumeurs rares, qui proviennent des cellules de la glande surrénale ou des nerfs voisins.
• Autres cancers – Des mutations du gène ATRX ont également été signalées dans un petit nombre de tumeurs du poumon, de la prostate, du pancréas et des sarcomes. L'importance de la perte du gène ATRX dans ces tumeurs reste à étudier.

Pourquoi l’ATRX est-il important dans un rapport de pathologie ?

Les pathologistes utilisent la perte d'expression d'ATRX pour diagnostiquer et classer certaines tumeurs, notamment les tumeurs cérébrales telles que les astrocytomes et les glioblastomes. L'absence d'ATRX dans une tumeur peut suggérer la présence d'une mutation génétique du gène ATRX.

Dans les gliomes, la perte d'ATRX est souvent associée à d'autres résultats de tests, tels que Mutation IDH statut et codéletion 1p/19q, pour aider à confirmer le type de tumeur et guider les décisions de traitement.

Dans le neuroblastome et les tumeurs neuroendocrines pancréatiques, les mutations ATRX peuvent influencer le pronostic et ouvrir la porte à des thérapies ciblées qui exploitent la capacité altérée des cellules cancéreuses à réparer l'ADN.

Questions à poser à votre médecin

• L'ATRX a-t-il été testé sur ma tumeur ?
• Que signifient les résultats du test ATRX pour mon diagnostic ou mon traitement ?
• La présence ou l’absence d’ATRX affecte-t-elle mon pronostic ?
• Le test ATRX pourrait-il suggérer une maladie génétique dans ma famille ?
• Devrais-je, moi ou les membres de ma famille, envisager un conseil génétique ou des tests supplémentaires ?