fusi



Dalam laporan patologi molekuler, kata fusi mengacu pada perubahan genetik tertentu di mana dua gen berbeda yang biasanya terpisah bergabung bersama. Penggabungan ini menciptakan gen hibrida baru yang menghasilkan protein abnormal. Peristiwa fusi ini terjadi di dalam sel kanker dan bukan sesuatu yang dimiliki seseorang sejak lahir. Karena hanya ditemukan di sel kanker, mengidentifikasi fusi dapat membantu dokter mendiagnosis jenis kanker tertentu, memandu keputusan pengobatan, dan memprediksi bagaimana penyakit tersebut dapat berkembang.

Mengapa fusi gen terjadi?

Penggabungan gen biasanya terjadi saat DNA di dalam sel rusak. DNA berisi instruksi untuk semua sel tubuh, dan saat rusak, bagian-bagiannya dapat disusun ulang secara tidak benar. Jika dua gen terpisah menyatu selama proses ini, hasilnya adalah gen hibrida baru. Kerusakan DNA yang menyebabkan penggabungan gen dapat terjadi secara kebetulan atau dipicu oleh paparan faktor lingkungan, seperti radiasi atau bahan kimia. Namun, dalam banyak kasus, penyebab pastinya tidak diketahui.

Apa yang terjadi pada sel setelah fusi terjadi?

Ketika terjadi fusi, gen hibrida baru memerintahkan sel untuk membuat protein abnormal. Dalam banyak kasus, protein ini mengganggu proses normal sel. Protein ini dapat memerintahkan sel untuk membelah diri secara tak terkendali, mengabaikan sinyal untuk berhenti tumbuh atau menghindari kematian sel normal. Akibatnya, sel yang mengalami fusi menjadi kanker, dan sel abnormal ini dapat berkembang biak dan membentuk tumor.

Bagaimana fusi gen menyebabkan kanker?

Fusi gen merupakan pendorong utama kanker karena dapat menghasilkan protein yang mengganggu mekanisme kontrol normal sel. Beberapa protein fusi bertindak seperti pedal gas, memberi tahu sel untuk terus tumbuh dan membelah. Yang lain dapat menonaktifkan protein yang biasanya bertindak sebagai rem, mencegah sel berhenti atau memperbaiki dirinya sendiri. Fusi gen sering ditemukan pada kanker darah, seperti leukemia, dan tumor padat, seperti sarkoma dan kanker paru-paru tertentu. Karena fusi ini unik untuk sel kanker, fusi ini juga dapat berfungsi sebagai target untuk terapi kanker tertentu.

Bagaimana ahli patologi menguji fusi gen?

Ahli patologi menggunakan beberapa tes khusus untuk mengidentifikasi fusi gen. Tes ini mengamati materi genetik dalam sel kanker untuk mendeteksi apakah dua gen telah menyatu.

Berikut ini adalah tes yang paling umum digunakan:

  1. Hibridisasi fluoresensi in situ (FISH): Uji ini menggunakan penanda fluoresens untuk mendeteksi fusi gen. Penanda akan menyala dalam pola tertentu di bawah mikroskop jika terjadi fusi.
  2. Reaksi berantai polimerase (PCR): Tes ini mencari gen fusi tertentu dengan menyalin segmen DNA atau RNA untuk melihat apakah fusi yang diketahui ada.
  3. Pengurutan generasi berikutnya (NGS): Uji lanjutan ini mengamati banyak gen sekaligus untuk mendeteksi fusi dan mutasi lainnya. Uji ini memberikan gambaran terperinci tentang perubahan genetik dalam sel kanker.
  4. Analisis kromosom (kariotipe): Teknik lama ini meneliti struktur kromosom untuk mengidentifikasi penataan ulang yang besar, termasuk fusi gen.

Hasil pengujian ini akan disertakan dalam laporan patologi, baik untuk mengonfirmasi keberadaan fusi atau menyatakan bahwa tidak ditemukan fusi. Laporan tersebut akan menyebutkan gen yang terlibat jika fusi tertentu terdeteksi.

Berikut adalah contoh bagaimana hasil fusi mungkin muncul dalam laporan patologi molekuler

Uji: Hibridisasi Fluoresensi In Situ (FISH)
Hasil: Positif untuk BCR::ABL1 fusi

Interpretasi: Sebuah fusi terdeteksi antara BCR gen pada kromosom 22 dan OJ1 gen pada kromosom 9. Penggabungan ini mengakibatkan terbentuknya protein abnormal yang memicu pertumbuhan sel tak terkendali.   BCR::ABL1 fusi merupakan ciri khas dari leukemia myeloid kronis (CML) dan beberapa jenis leukemia limfoblastik akut (ALL). Temuan ini mengonfirmasi diagnosis dan menunjukkan bahwa pasien dapat memperoleh manfaat dari terapi bertarget dengan penghambat tirosin kinase, seperti imatinib atau dasatinib.

Dalam contoh ini, laporan mengidentifikasi BCR::ABL1 fusi yang umumnya dikaitkan dengan leukemia myeloid kronis (CML). Fusi ini menghasilkan protein yang menyebabkan sel kanker tumbuh tak terkendali. Mendeteksi fusi ini membantu memastikan diagnosis dan memandu pengobatan, karena penghambat tirosin kinase (TKI) seperti imatinib atau dasatinib sangat efektif melawan kanker dengan perubahan genetik spesifik ini.

Apa fusi gen yang paling umum?

Berikut adalah daftar beberapa fusi gen yang paling umum dan kanker terkait:

  • BCR::ABL1 – Leukemia myeloid kronik (CML) dan leukemia limfoblastik akut (ALL)
  • ETV6::RUNX1 – Leukemia limfoblastik akut (ALL)
  • PML::RARA – Leukemia promielositik akut (APL)
  • EWSR1::FLI1 – Sarkoma Ewing
  • TMPRSS2::ERG - Kanker prostat
  • ALK::EML4 – Kanker paru non-sel kecil (NSCLC)
  • CBFB::MYH11 – Leukemia myeloid akut (LMA)
  • RUNX1::RUNX1T1 – Leukemia myeloid akut (LMA)
  • FUS::DDIT3 – Liposarkoma miksoid
  • SS18::SSX1/SSX2 – Sarkoma sinovial
  • ETV6::NTRK3 – Fibrosarkoma infantil dan kanker payudara sekretori
  • KMT2A (MLL)::AF4 – Leukemia limfoblastik akut (ALL)
  • Fusi ROS1 – Kanker paru non-sel kecil (NSCLC)
  • RET::PTC - Kanker tiroid
  • Fusi PDGFRB – Leukemia mielomonositik kronik (CMML)
  • BCOR::CCNB3 – Sarkoma sel jernih pada ginjal
  • NUP98::NSD1 – Leukemia myeloid akut (LMA)
  • EWSR1::ATF1 – Sarkoma sel jernih
  • TCF3::PBX1 – Leukemia limfoblastik akut (ALL)
  • BRAF::KIAA1549 – Astrositoma pilositik
  • Fusi NTRK1 – Kanker tiroid dan glioma pediatrik
  • Fusi NTRK2 – Glioma tingkat tinggi pada anak-anak
  • Fusi NTRK3 – Kanker payudara sekretori dan nefroma mesoblastik kongenital
  • FGFR1::TACC1 – Glioblastoma dan glioma lainnya
  • Fusi FGFR2 – Kolangiokarsinoma dan kanker endometrium
  • FGFR3::TACC3 – Kanker kandung kemih dan karsinoma sel skuamosa paru-paru
  • ETV6::ABL1 – Leukemia limfoblastik akut (ALL)
  • ABL1::NUP214 – Leukemia limfoblastik akut (ALL)
  • PAX3::FOXO1 – Rabdomiosarkoma alveolar
  • PAX7::FOXO1 – Rabdomiosarkoma alveolar
  • EWSR1::WT1 – Tumor sel bulat kecil desmoplastik
  • fusi TFE3 – Karsinoma sel ginjal translokasi Xp11
  • FUS::ERG – Sarkoma mirip Ewing
  • CD74::ROS1 – Kanker paru non-sel kecil (NSCLC)
  • STRN::ALK – Kanker paru non-sel kecil (NSCLC)
  • KMT2A (MLL):: ELL – Leukemia myeloid akut (LMA)
  • NUP98::KDM5A – Leukemia myeloid akut (LMA)
  • CREB1::ATF1 – Histiositoma fibrosa angiomatoid
  • PRCC::TFE3 – Karsinoma sel ginjal
  • EWSR1::POU5F1 – Sarkoma sel bulat kecil

Setiap fusi gen memainkan peran penting dalam kanker tempat fusi tersebut ditemukan. Mengidentifikasi fusi gen akan memastikan diagnosis dan membantu dokter memilih terapi yang dirancang khusus untuk menargetkan perubahan genetik ini.

Artikel terkait di MyPathologyReport

Biomarker kanker
Mutasi
A+ A A-