In situ blending (ISH)

Hvað er in situ blending?

In situ blending (ISH) er rannsóknarstofupróf notað til að sjá erfðaefni, svo sem DNA eða RNA, innan frumna eða vefja. Það er almennt notað í læknisfræði til að bera kennsl á og sjá tiltekna gen eða genaafurðir og til að greina smitefni eins og veirur.

Hvernig virkar in situ blending?

ISH felur í sér að nota lítið merkt stykki af erfðaefni (kjarnsýrurannsókn) sem er viðbót (öfugt) við markerfðaefnið. Hægt er að sameina rannsakann við ýmsar tegundir merkimiða, svo sem flúrljómandi litarefni, geislavirkar samsætur eða ensím, sem gera rannsakanda kleift að sjást inni í frumum.

Til þess að framkvæma ISH er vefjasýni fyrst fest og unnið til að varðveita uppbyggingu þess og undirbúa það fyrir blendingu. Vefurinn er síðan ræktaður með merkta rannsakandanum, sem festist (blendingar) við markerfðaefnið ef það er til staðar. Afgangurinn af rannsakandanum er síðan þveginn burt og eftirstöðvar rannsakans-markmiðsins eru greindar með einni af nokkrum aðferðum.

Hverjar eru mismunandi tegundir af in situ blendingum?

Það eru nokkrar mismunandi gerðir af ISH tækni, þar á meðal flúrljómandi in situ blending (FISH), litningafræðilega blending á staðnum (CISH), og RNA in situ blending (ISH-RNA). FISH og CISH nota flúrljómandi eða litningamerki, í sömu röð, til að sjá staðsetningu erfðaefnisins sem markið er, en ISH-RNA greinir sérstaklega RNA sameindir innan frumna eða vefja.