
ציטופלזמה היא חומר דמוי ג'לי הממלא את פנים התא, ומחזיק את כל חלקי התא במקומם. היא מורכבת בעיקר ממים ומכילה חלבונים, חומרים מזינים ומבנים זעירים מיוחדים הנקראים אברונים (כגון מיטוכונדריה, ליזוזומים וגרעין התא). הציטופלזמה עטופה בשכבה מגנה דקה הנקראת קרום התא, המפרידה בין פנים התא לסביבתו הסובבת.
ציטופלזמה חשובה משום שהיא מסייעת לתא לבצע פונקציות חיוניות. היא מספקת סביבה יציבה לאברונים, ומאפשרת להם לייצר אנרגיה, לפרק פסולת וליצור חלבונים חדשים. ציטופלזמה גם מסייעת לתאים לשמור על צורתם ומבנם.
פתולוגים בוחנים תאים תחת מיקרוסקופ באמצעות צבעים מיוחדים הנקראים המטוקסילין ואאוזין (H&E). המטוקסילין צובע חלקים מסוימים של התא (כמו הגרעין) בכחול כהה או סגול, בעוד שאאוזין צובע את הציטופלזמה בוורוד. צבעים אלה מאפשרים לפתולוגים לראות בבירור את הגודל, הצורה והמראה של הציטופלזמה, מה שיכול לסייע בזיהוי סוגי תאים שונים ובאבחון מחלות.
כן, כמות הציטופלזמה משתנה מאוד בהתאם לסוג התא. לדוגמה, לתאי קשקש על פני העור יש כמות גדולה של ציטופלזמה, מה שנותן להם צורה שטוחה אופיינית. מצד שני, לתאי חיסון מיוחדים הנקראים לימפוציטים יש ציטופלזמה קטנה מאוד ונראים קטנים וקומפקטיים יותר תחת מיקרוסקופ.
פתולוגים משתמשים במונחים תיאוריים ספציפיים כאשר הם בוחנים ציטופלזמה תחת מיקרוסקופ, כולל:
אאוזינופיליתאים עם ציטופלזמה אאוזינופילית נראים ורודים בוהקים משום שהם מכילים כמות גבוהה של חומר עשיר בחלבון.
אונקוציטיתאים עם ציטופלזמה אונקוציטית נראים ורודים עקב קיומם של מיטוכונדריה רבות (מבנים המייצרים אנרגיה) בתוך הציטופלזמה.
נקהתאים עם ציטופלזמה צלולה נראים שקופים משום שהם מכילים מעט רכיבים הסופגים את הכתמים.
בזופיליתאים עם ציטופלזמה בזופילית נראים כחולים או סגולים משום שהם מכילים חומרים המושכים חזק את צבע ההמטוקסילין.
מראה הציטופלזמה יכול לספק רמזים לגבי סוג התא והאם התא בריא או חולה. לדוגמה, לתאי סרטן יש לעיתים קרובות ציטופלזמה שנראית חריגה, וזיהוי שינויים אלה יכול לעזור לפתולוגים לאבחן סרטן ולקבוע את גישת הטיפול הטובה ביותר.