在分子病理学报告中, 聚变 指一种特定的基因变化,其中两个通常分开的不同基因结合在一起。这种结合产生了一个新的混合基因,该基因会产生异常蛋白质。这些融合事件发生在癌细胞内,并不是人与生俱来的。因为它们只存在于癌细胞中,所以识别融合可以帮助医生诊断特定类型的癌症,指导治疗决策,并预测疾病可能如何表现。
为什么会发生基因融合?
基因融合通常发生在细胞内的 DNA 受损时。DNA 包含人体所有细胞的指令,当 DNA 断裂时,碎片可能会被错误地重新排列。如果两个不同的基因在此过程中融合,就会产生一个新的混合基因。导致基因融合的 DNA 损伤可能是偶然发生的,也可能是由暴露于辐射或化学物质等环境因素引起的。然而,在许多情况下,确切的原因尚不清楚。
融合发生后细胞会发生什么?
当发生融合时,新的杂交基因会指示细胞产生异常蛋白质。在许多情况下,这些蛋白质会干扰细胞的正常过程。它们会指示细胞不受控制地分裂,忽略停止生长的信号或避免正常细胞死亡。结果,融合的细胞会变成癌细胞,这些异常细胞会增殖并形成肿瘤。
基因融合如何导致癌症?
基因融合是癌症的重要驱动因素,因为它们可以产生破坏细胞正常控制机制的蛋白质。一些融合蛋白就像油门一样,告诉细胞继续生长和分裂。其他融合蛋白可以禁用通常充当刹车的蛋白质,防止细胞停止或自我修复。基因融合通常存在于血癌中,例如 白血病以及实体肿瘤,例如 肉瘤 以及某些肺癌。由于这些融合是癌细胞所特有的,因此它们也可以作为特定癌症治疗的靶点。
病理学家如何检测基因融合?
病理学家使用几种专门的测试来识别基因融合。这些测试观察癌细胞中的遗传物质,以检测两个基因是否融合。
以下是最常用的测试:
- 荧光原位杂交 (FISH): 该测试使用荧光标记来检测基因融合。如果存在融合,标记将在显微镜下以特定模式亮起。
- 聚合酶链式反应 (PCR): 该测试通过复制 DNA 或 RNA 片段来寻找特定的融合基因,以查看是否存在已知的融合。
- 下一代测序 (NGS): 这项先进的检测可同时检测多个基因,以检测融合和其他突变。它可详细了解癌细胞中的基因变化。
- 染色体分析(核型分析): 这项较旧的技术通过检查染色体的结构来识别大的重排,包括基因融合。
这些测试的结果将包含在病理报告中,要么确认存在融合,要么说明未发现融合。如果检测到特定融合,报告将列出所涉及的基因。
以下是融合结果在分子病理学报告中的显示示例
测试: 荧光原位杂交 (FISH)
结果: 积极为 BCR::ABL1 聚变
解读: 检测到融合 BCR 22 号染色体上的基因和 1号 9号染色体上的基因。这种融合导致一种异常蛋白质的形成,从而驱动不受控制的细胞生长。 此 BCR::ABL1 融合的特点是 慢性粒细胞白血病 (CML) 和某些类型的 急性淋巴细胞白血病(ALL). 这一发现证实了诊断,并表明患者可能受益于酪氨酸激酶抑制剂(例如伊马替尼或达沙替尼)的靶向治疗。
在此示例中,报告标识了 BCR::ABL1 融合通常与慢性粒细胞白血病 (CML) 有关。这种融合会产生一种蛋白质,导致癌细胞不受控制地生长。检测这种融合有助于确认诊断并指导治疗,因为酪氨酸激酶抑制剂 (TKI)(如伊马替尼或达沙替尼)对具有这种特定基因变化的癌症非常有效。
最常见的基因融合有哪些?
以下列出了一些最常见的基因融合及其相关癌症:
- BCR::ABL1 – 慢性粒细胞白血病 (CML) 和急性淋巴细胞白血病 (ALL)
- ETV6::RUNX1 – 急性淋巴细胞白血病 (ALL)
- 经皮骨髓纤维化::RARA – 急性早幼粒细胞白血病 (APL)
- EWSR1::FLI1 – 尤文氏肉瘤
- TMPRSS2::ERG - 前列腺癌
- ALK::EML4 – 非小细胞肺癌(NSCLC)
- CBFB::MYH11 – 急性髓细胞白血病 (AML)
- 运行1::运行1T1 – 急性髓细胞白血病 (AML)
- FUS::DDIT3 – 粘液样脂肪肉瘤
- SS18::SSX1/SSX2 – 滑膜肉瘤
- ETV6::NTRK3 – 婴儿纤维肉瘤和分泌性乳腺癌
- KMT2A (MLL)::AF4 – 急性淋巴细胞白血病 (ALL)
- ROS1 融合 – 非小细胞肺癌(NSCLC)
- RET::PTC - 甲状腺癌
- PDGFRB 融合 – 慢性粒单核细胞白血病 (CMML)
- 加拿大皇家银行::CCNB3 – 肾透明细胞肉瘤
- NUP98::NSD1 – 急性髓细胞白血病 (AML)
- EWSR1::ATF1 – 透明细胞肉瘤
- TCF3::PBX1 – 急性淋巴细胞白血病 (ALL)
- BRAF::KIAA1549 – 毛细胞星形细胞瘤
- NTRK1 融合 – 甲状腺癌和儿童神经胶质瘤
- NTRK2 融合 – 儿童高级别胶质瘤
- NTRK3 融合 – 分泌性乳腺癌和先天性中胚层肾瘤
- FGFR1::TACC1 – 胶质母细胞瘤和其他胶质瘤
- FGFR2 融合 – 胆管癌和子宫内膜癌
- FGFR3::TACC3 – 膀胱癌和肺鳞状细胞癌
- ETV6::ABL1 – 急性淋巴细胞白血病 (ALL)
- ABL1::NUP214 – 急性淋巴细胞白血病 (ALL)
- PAX3::FOXO1 – 肺泡横纹肌肉瘤
- PAX7::FOXO1 – 肺泡横纹肌肉瘤
- EWSR1::WT1 – 促纤维增生性小圆细胞肿瘤
- TFE3 融合 – Xp11 易位肾细胞癌
- FUS::ERG – 尤文氏肉瘤
- CD74::ROS1 – 非小细胞肺癌(NSCLC)
- 斯特恩::ALK – 非小细胞肺癌(NSCLC)
- KMT2A (MLL)::ELL – 急性髓细胞白血病 (AML)
- NUP98::KDM5A – 急性髓细胞白血病 (AML)
- CREB1::ATF1 – 血管瘤样纤维组织细胞瘤
- PRCC::TFE3 – 肾细胞癌
- EWSR1::POU5F1 – 小圆细胞肉瘤
每种基因融合都会对癌症产生重大影响。识别这些基因融合可确认诊断,并帮助医生选择专门针对这些基因变化的疗法。
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