Variantenallelfrequenz: Definition

Die Variantenallelfrequenz (VAF) ist ein Messwert, der bei der genetischen Untersuchung von Tumoren verwendet wird. Sie beschreibt, wie häufig eine bestimmte genetische Veränderung in einer untersuchten Gewebeprobe vorkommt und wird üblicherweise als Prozentsatz angegeben.

Tumore werden häufig auf genetische Veränderungen untersucht, da diese Aufschluss darüber geben können, warum ein Krebs entstanden ist, wie er sich verhält und welche Behandlungen am besten wirken. Eine genetische Veränderung wird als Variante bezeichnet, und die meisten Zellen besitzen normalerweise zwei Kopien (Allele) jedes Gens. Die Allelfrequenz einer Variante gibt Ärzten Auskunft darüber, welcher Anteil dieser Genkopien die Variante trägt.

Ein VAF-Wert von 50 % bedeutet beispielsweise, dass etwa die Hälfte der getesteten DNA-Kopien die genetische Veränderung enthält, während ein VAF-Wert von 10 % bedeutet, dass die Veränderung in weniger Zellen vorhanden ist.

Warum ist die Allelfrequenz von Varianten wichtig?

Die Allelfrequenz von Varianten hilft Ärzten zu verstehen, wie weit verbreitet eine genetische Veränderung innerhalb eines Tumors ist.

Ein höherer VAF-Wert bedeutet in der Regel, dass die Variante in vielen Tumorzellen vorhanden ist. Dies kann darauf hindeuten, dass die Veränderung früh in der Tumorentwicklung stattfand oder eine wichtige Rolle für das Tumorwachstum spielt.

Ein niedrigerer VAF-Wert bedeutet, dass die Variante in weniger Zellen vorkommt. Dies kann der Fall sein, wenn ein Tumor eine Mischung verschiedener Zellpopulationen enthält, wenn die Veränderung erst später aufgetreten ist oder wenn die Probe sowohl Tumorzellen als auch normale Zellen umfasst.

Auch Varianten mit einer niedrigen VAF können von Bedeutung sein, insbesondere wenn sie sich auf Behandlungsentscheidungen auswirken.

Wie wird die Allelfrequenz einer Variante gemessen?

Die Häufigkeit von Allelvarianten wird mithilfe molekularer Tests, meist der Next-Generation-Sequenzierung (NGS) , gemessen . Diese Tests untersuchen Tausende bis Millionen von DNA-Fragmenten und zählen, wie viele die Variante enthalten und wie viele nicht.

Da diese Tests hochsensibel sind, können sie genetische Veränderungen selbst dann nachweisen, wenn diese nur in einem kleinen Teil der Zellen vorhanden sind.

Lässt die Häufigkeit von Variantenallelen Rückschlüsse auf die Aggressivität einer Krebserkrankung zu?

Nein. Die Allelfrequenz einer Variante gibt allein weder Aufschluss über die Tumorgröße noch über das Krebsstadium oder die Aggressivität. Sie liefert vielmehr Informationen darüber, wie häufig eine genetische Veränderung in der untersuchten Probe vorkommt.

Ärzte interpretieren die VAF immer zusammen mit der Tumorart, den pathologischen Befunden, den Bildgebungsergebnissen und der Krankengeschichte.

Lässt die Allelfrequenz einer Variante erkennen, ob eine genetische Veränderung vererbt wird?

Nicht allein. Die Häufigkeit von Variantenallelen kann nicht zuverlässig bestimmen, ob eine genetische Veränderung vererbt wurde oder erst im Tumor entstanden ist.

In einigen Fällen kann eine VAF nahe 50 % im nicht-tumoralen Gewebe auf eine vererbte Variante hindeuten, jedoch sind weitere Tests erforderlich, um dies zu bestätigen.

Kann sich die Häufigkeit von Allelvarianten im Laufe der Zeit verändern?

Ja. Die Häufigkeit von Allelvarianten kann sich im Laufe des Tumorwachstums, des Ansprechens auf eine Behandlung oder der Entstehung neuer Krebszellgruppen verändern. Aus diesem Grund können wiederholte Tests im Zeitverlauf mitunter unterschiedliche VAF-Werte ergeben.

Warum könnte die Allelfrequenz einer Variante in meinem Pathologiebericht aufgeführt werden?

Die Häufigkeit der Allelvariante wird angegeben, um Ärzten zu helfen, die Bedeutung einer genetischen Veränderung in Ihrem Tumor besser zu verstehen. Diese Information kann die Behandlungsentscheidungen unterstützen, das Tumorverhalten erklären und gegebenenfalls Folgeuntersuchungen ermöglichen.

Fragen an Ihren Arzt

• Welche genetischen Veränderungen wurden in meinem Tumor festgestellt?

• Wie hoch ist die Allelfrequenz der Varianten für diese Veränderungen?

• Hat die VAF Auswirkungen auf meine Behandlungsmöglichkeiten?

• Könnte diese genetische Veränderung vererbt werden?

• Werden in Zukunft wiederholte Tests erforderlich sein?