การหาลำดับยุคถัดไปทำงานอย่างไร
การจัดลำดับยุคต่อไปถูกนำมาใช้ในพยาธิวิทยาอย่างไร
NGS ใช้ในพยาธิวิทยาเพื่อช่วยวินิจฉัยและรักษาโรคที่เกิดจากการเปลี่ยนแปลงของ DNA หรือ RNA ตัวอย่างเช่น มะเร็งบางชนิดเกิดจากการกลายพันธุ์ (การเปลี่ยนแปลงเล็กน้อย) หรือการจัดเรียงใหม่ (การเปลี่ยนแปลงขนาดใหญ่) ใน DNA ของยีนบางชนิดที่ทำให้เซลล์เติบโตอย่างควบคุมไม่ได้ หลังจากตรวจตัวอย่างเนื้อเยื่อใต้กล้องจุลทรรศน์แล้ว นักพยาธิวิทยาอาจทำการตรวจ NGS เพื่อจำกัดขอบเขตหรือยืนยันการวินิจฉัย NGS มักใช้ร่วมกับการทดสอบประเภทอื่นๆ เช่น อิมมูโนฮิสโตเคมี (IHC), การผสมพันธุ์แบบเรืองแสงในแหล่งกำเนิด (FISH),หรือ โฟลว์ไซโตเมทรี.
NGS ยังสามารถใช้เพื่อเลือกยาที่สามารถกำหนดเป้าหมายการเปลี่ยนแปลงที่ระบุในเนื้องอกได้ สิ่งนี้มักถูกเรียกว่าเป็นยาที่แม่นยำเพราะช่วยให้การรักษาที่ถูกต้องแก่ผู้ป่วยที่ถูกต้องในเวลาที่เหมาะสม NGS ยังสามารถช่วยค้นหาว่าบุคคลตอบสนองต่อยาอย่างไรโดยพิจารณาจาก DNA หรือ RNA ของพวกเขา ตัวอย่างเช่น บางคนมี DNA ที่แตกต่างกันซึ่งทำให้พวกเขาเผาผลาญยาได้เร็วหรือช้ากว่าคนอื่นๆ ซึ่งอาจส่งผลต่อประสิทธิภาพของยาหรือแนวโน้มที่จะก่อให้เกิดผลข้างเคียง NGS สามารถช่วยระบุรูปแบบเหล่านี้และปรับขนาดหรือประเภทของยาให้เหมาะสมได้ สิ่งนี้เรียกว่าเภสัชพันธุศาสตร์หรือเภสัชพันธุศาสตร์เนื่องจากช่วยปรับแต่งการรักษาด้วยยาตามลักษณะทางพันธุกรรมของบุคคล
การเปลี่ยนแปลงทางพันธุกรรมที่พบบ่อยที่สุดบางส่วนได้รับการทดสอบโดยการหาลำดับยุคถัดไปมีอะไรบ้าง
NGS สามารถใช้ค้นหาการเปลี่ยนแปลงทางพันธุกรรมได้หลายพันรายการ อย่างไรก็ตาม ปัจจุบันมีการประเมินยีนเพียงจำนวนเล็กน้อยเท่านั้น
การเปลี่ยนแปลงทางพันธุกรรมที่ NGS ประเมินโดยทั่วไป ได้แก่:
- EGFR, KRAS, BRAF และ PIK3CA: ยีนเหล่านี้เป็นยีนที่เกี่ยวข้องกับการเจริญเติบโตและการแบ่งตัวของเซลล์ และสามารถกลายพันธุ์หรือเปลี่ยนแปลงได้ในมะเร็งบางชนิด การทดสอบยีนเหล่านี้สามารถช่วยวินิจฉัยประเภทและระยะของมะเร็งได้ รวมทั้งเป็นแนวทางในการเลือกวิธีการรักษา ตัวอย่างเช่น ยาบางชนิดสามารถกำหนดเป้าหมายมะเร็งที่มีการกลายพันธุ์ใน EGFR หรือ BRAF1
- NTRK, ROS1 และ ALK: เหล่านี้เป็นยีนที่เข้ารหัสโปรตีนที่เรียกว่าตัวรับไทโรซีนไคเนส ซึ่งเกี่ยวข้องกับการเจริญเติบโตและการแบ่งตัวของเซลล์ด้วย มะเร็งบางชนิดมีการจัดเรียงใหม่หรือการหลอมรวมของยีนเหล่านี้กับยีนอื่นๆ ซึ่งอาจทำให้เซลล์เติบโตจนควบคุมไม่ได้ การทดสอบยีนเหล่านี้สามารถช่วยระบุมะเร็งที่สามารถรักษาได้ด้วยยาที่ขัดขวางการทำงานของตัวรับเหล่านี้
- CFTR, PAH, GALT และ HBB: เหล่านี้เป็นยีนที่เกี่ยวข้องกับความผิดปกติที่สืบทอดมาซึ่งส่งผลต่ออวัยวะหรือระบบต่างๆในร่างกาย การทดสอบยีนเหล่านี้สามารถช่วยวินิจฉัยหรือคัดกรองความผิดปกติเหล่านี้ได้ พร้อมทั้งให้ข้อมูลเกี่ยวกับความเสี่ยงในการส่งต่อให้กับเด็ก ตัวอย่างเช่น CFTR คือยีนที่ทำให้เกิดโรคซิสติก ไฟโบรซิส ซึ่งเป็นโรคที่ส่งผลต่อปอดและระบบย่อยอาหาร PAH เป็นยีนที่ทำให้เกิดฟีนิลคีโตนูเรีย ซึ่งเป็นโรคที่ส่งผลต่อการเผาผลาญกรดอะมิโนที่เรียกว่าฟีนิลอะลานีน GALT เป็นยีนที่ทำให้เกิดกาแลคโตซีเมีย ซึ่งเป็นโรคที่ส่งผลต่อการเผาผลาญน้ำตาลที่เรียกว่ากาแลคโตส และ HBB คือยีนที่ทำให้เกิดโรคเม็ดเลือดรูปเคียวซึ่งเป็นโรคที่ส่งผลต่อรูปร่างและการทำงานของเม็ดเลือดแดง
- BRCA1 และ BRCA2: เหล่านี้เป็นยีนที่เกี่ยวข้องกับการซ่อมแซม DNA และการป้องกันจากความเสียหาย การกลายพันธุ์หรือการเปลี่ยนแปลงของยีนเหล่านี้อาจเพิ่มความเสี่ยงในการเป็นมะเร็งเต้านม มะเร็งรังไข่ ต่อมลูกหมาก หรือมะเร็งตับอ่อน การทดสอบยีนเหล่านี้สามารถช่วยระบุผู้ที่มีโอกาสสูงที่จะเป็นมะเร็งเหล่านี้ รวมทั้งให้ทางเลือกในการป้องกันหรือการตรวจหามะเร็งในระยะเริ่มแรก
- EWSR1, FUS และ SS18: เหล่านี้เป็นยีนที่เข้ารหัสโปรตีนที่เรียกว่าปัจจัยการถอดรหัส ซึ่งเกี่ยวข้องกับการควบคุมการแสดงออกของยีน บาง Sarcomas มีการหลอมรวมหรือการจัดเรียงใหม่ของยีนเหล่านี้กับยีนอื่น ๆ ซึ่งอาจส่งผลต่อความแตกต่างและการพัฒนาของเซลล์ การทดสอบยีนเหล่านี้สามารถช่วยจำแนกประเภทและชนิดย่อยของซาร์โคมาได้
- PDGFRA, PDGFRB และ KIT: เหล่านี้เป็นยีนที่เข้ารหัสโปรตีนที่เรียกว่าตัวรับปัจจัยการเจริญเติบโตที่ได้จากเกล็ดเลือด ซึ่งเกี่ยวข้องกับการเจริญเติบโตและการแบ่งตัวของเซลล์ด้วย บาง Sarcomas มีการกลายพันธุ์หรือการขยายตัวของยีนเหล่านี้ ซึ่งทำให้เซลล์ตอบสนองต่อสัญญาณการเจริญเติบโตได้ดีขึ้น การทดสอบยีนเหล่านี้สามารถช่วยระบุมะเร็งซาร์โคมาที่สามารถรักษาได้ด้วยยาที่ยับยั้งตัวรับเหล่านี้
