什么是重排？

在分子病理学报告中， “重排”一词指的是细胞内DNA结构的改变。DNA通常以长链形式存在，称为染色体，每条染色体包含许多基因。当染色体上的一段DNA断裂并连接到其他位置时，就会发生重排，这种连接可能发生在同一条染色体上，也可能发生在另一条染色体上。这种改变会影响基因的功能，有时甚至会导致癌症的发生。

为什么会发生重排？

DNA重排的发生原因有很多。有些是偶然发生的，例如细胞在复制自身DNA时出错。环境因素，例如暴露于辐射或有害化学物质，也会导致DNA重排。有时，人们可能遗传了某些基因倾向，使他们的细胞更容易发生DNA重排。然而，大多数癌症中发生的DNA重排并非遗传而来，而是随着时间的推移在特定细胞中逐渐形成的，称为体细胞重排。

重排发生后细胞会发生什么情况？

当发生重排时，它可以改变特定基因的功能。有时，这会导致基因变得比应有的更活跃，而有时，它会使控制细胞所需的基因沉默。如果重排涉及控制细胞生长的基因，受影响的细胞可能会不受控制地分裂，最终导致肿瘤。然而，并非所有的重排都会造成伤害；有些重排不会影响细胞。

重排如何导致癌症？

基因重排可以将两个不同的基因结合在一起，形成融合基因。融合基因可以产生异常蛋白，促进细胞不受控制地生长。在其他情况下，基因重排可能会破坏通常抑制细胞分裂的抑癌基因。失去这些控制后，细胞就会不受控制地增殖，最终形成肿瘤。

重排一定会导致癌症吗？

并非所有基因重排都会导致癌症。许多重排的发生并不影响细胞功能。这些重排有时被称为“乘客重排”，因为它们虽然存在，但并不影响肿瘤生长。只有当重排涉及控制细胞生长和分裂的特定基因时，才可能导致癌症。即便如此，重排也必须以某种方式影响细胞，使其不受控制地生长。

病理学家如何检测重排？

病理学家使用多种技术来检测肿瘤细胞中的重排：

• 荧光原位杂交（FISH）: 该测试使用荧光探针检测特定的 DNA 变化。它 有助于识别更大的重排或 聚变 涉及已知基因的事件。
• 聚合酶链反应 (PCR)： PCR 扩增小片段 DNA 以检测特定的已知重排，例如涉及融合基因的重排。
• 下一代测序 (NGS): NGS 允许病理学家对大面积 DNA 区域进行测序，以发现各种各样的重排，包括那些难以用其他方法检测到的重排。
• 核型分析： 该测试在显微镜下检查染色体的结构，以识别大规模重排。它通常用于研究血癌，例如 白血病.

这些测试的结果将表明是否发现任何重排以及它们是否可能影响治疗。

以下是重排结果在分子病理学报告中的显示示例：

测试： 荧光原位杂交 (FISH)
结果： 积极为 ALK-EML4 聚变

解读：在肿瘤细胞中检测到ALK-EML4融合基因。这种重排常见于非小细胞肺癌（NSCLC），提示肿瘤可能对ALK抑制剂（如克唑替尼或阿来替尼）有良好的反应。

在这个例子中，报告证实患者的癌细胞含有ALK-EML4融合基因，这意味着2号染色体上的ALK基因的一部分与EML4基因融合。这种融合产生了一种异常蛋白，从而促进癌细胞生长。阳性结果表明，靶向治疗——即专门用于阻断异常ALK蛋白的药物——可能对治疗肿瘤有效。

最常见的基因重排及其相关癌症有哪些？

以下是常见基因重排及其常见癌症的列表：

• BCR-ABL1： 慢性粒细胞白血病和急性淋巴细胞白血病
• ETV6-RUNX1： 急性淋巴细胞白血病
• PML-RAR： 急性早幼粒细胞白血病
• ALK-EML4： 非小细胞肺癌
• TMPRSS2-ERG： 前列腺癌
• EWSR1-FLI1： 尤文氏肉瘤
• CCND1-IGH： 套细胞淋巴瘤
• BCL2-IGH： 滤泡性淋巴瘤
• BCL6-IGH： 弥漫性大B细胞淋巴瘤
• NPM1-ALK： 间变性大细胞淋巴瘤
• MYC-IGH： 伯基特淋巴瘤
• SS18-SSX1： 滑膜肉瘤
• RET-PTC： 甲状腺癌
• ROS1-CD74： 非小细胞肺癌
• CBFB-MYH11： 急性髓系白血病
• 运行1-运行1T1： 急性髓系白血病
• MLL-AF9： 急性髓系白血病
• EWSR1-ATF1： 透明细胞肉瘤
• TFE3-ASPSCR1： 肺泡软部肉瘤
• FGFR3-TACC3： 膀胱癌
• NTRK1-TPM3： 甲状腺癌
• NTRK3-ETV6： 分泌性乳腺癌
• KMT2A-ELL： 急性髓系白血病
• FGFR1-ZMYM2： 髓系/淋巴系肿瘤
• PDGFRA-FIP1L1： 胃肠道间质瘤 (GIST)
• TBL1XR1-PLAG1： 涎腺癌
• PRKAR1A-RET： 甲状腺癌
• BRAF-KIAA1549： 毛细胞型星形细胞瘤
• EWSR1-WT1： 促纤维增生性小圆细胞肿瘤
• FOXO1-PAX3： 肺泡横纹肌肉瘤
• FGFR2-BICC1： 胆管癌
• CDK4-MDM2： 脂肪肉瘤
• NUP98-HOXA9： 急性髓系白血病
• ETV1-ELK4： 前列腺癌
• TCF3-HLF： 急性淋巴细胞白血病
• ZRSR2-MLL： 急性髓系白血病
• PAX8-PPARγ： 甲状腺癌
• BCOR-CCN​​B3： 肉瘤
• CIC-DUX4： 尤文氏肉瘤
• ERBB2-MLL： 乳腺癌

每种基因重排都会对癌症产生重大影响。识别这些基因重排可确认诊断，并帮助医生选择专门针对这些基因变化的疗法。