ATRX: Определение

ATRX расшифровывается как альфа-талассемия/умственная отсталость, сцепленная с Х-хромосомой . Ген ATRX содержит инструкции для производства белка ATRX, который играет решающую роль в упаковке и восстановлении ДНК внутри наших клеток. Этот белок помогает контролировать, какие гены включаются или выключаются, поддерживает восстановление ДНК и сохраняет концы хромосом, известные как теломеры.

ATRX классифицируется как ген-супрессор опухолей, что означает, что он обычно помогает предотвратить развитие рака, регулируя рост и деление клеток контролируемым образом.

Что делает ATRX?

Белок ATRX выполняет множество важных функций внутри клетки:

• Ремоделирование хроматина: ДНК упаковывается вокруг белков, называемых гистонами, образуя структуру, называемую хроматином. ATRX помогает перестраивать эту структуру, позволяя генам включаться и выключаться в нужное время.
• Восстановление ДНК: ATRX помогает восстанавливать поврежденную ДНК и способствует восстановлению клеток при повреждении ДНК.
• Поддержание теломер: ATRX помогает защищать теломеры — участки на концах хромосом, которые поддерживают стабильность нашего генетического материала.
• Контроль экспрессии генов: ATRX влияет на то, какие гены активны или неактивны в различных типах клеток.

ATRX тесно взаимодействует с другим белком, DAXX, и вместе они помогают разместить особую версию гистонового белка (H3.3) в определенных областях ДНК, особенно в повторяющихся или плотно упакованных регионах.

Какие типы нормальных клеток экспрессируют ATRX?

ATRX присутствует практически во всех клетках организма. Он особенно активен в клетках, которые быстро делятся или имеют сложную структуру ДНК, например, в клетках мозга и эмбриональных клетках на ранних стадиях развития. В мозге он играет важную роль в нормальном развитии.

Как патологоанатомы проверяют наличие ATRX?

Патологи обычно проводят исследование на наличие ATRX с помощью метода иммуногистохимии . Этот тест использует специальные антитела, которые связываются с белком ATRX в образце ткани. При рассмотрении под микроскопом клетки с нормальной экспрессией ATRX будут демонстрировать темно-коричневое окрашивание в ядре . Это называется положительным результатом, указывающим на присутствие белка ATRX.

Если белок ATRX отсутствует из-за мутации в гене ATRX, окрашивание в ядре опухолевой клетки не будет наблюдаться. Это называется отрицательным результатом, указывающим на мутацию или другое изменение, затрагивающее ген ATRX. Важно отметить, что патологи будут искать положительное окрашивание в окружающих нормальных (неопухолевых) клетках в качестве встроенного контроля, чтобы убедиться в правильности проведения теста.

В некоторых случаях, особенно при наследственных заболеваниях или в исследовательских целях, для непосредственного изучения последовательности ДНК гена ATRX может использоваться генетический тест. Часто это делается с помощью секвенирования нового поколения (NGS) , которое считывает код гена и может обнаруживать мутации, делеции или другие изменения.

Какие типы опухолей демонстрируют изменения в ATRX?

Ген ATRX часто изменён при некоторых типах опухолей. Эти изменения обычно являются результатом мутации, приводящей к потере белка ATRX в опухолевых клетках.

• Глиомы – Многие взрослые и детские глиомы высокой степени злокачественности (опухоли головного и спинного мозга) демонстрируют потерю экспрессии ATRX. Это особенно часто встречается при астроцитомах и других глиомах с мутациями в гене IDH.
• Нейроэндокринные опухоли поджелудочной железы. Потеря ATRX наблюдается в некоторых нейроэндокринных опухолях поджелудочной железы и связана с хромосомной нестабильностью и худшими результатами выживания.
• Опухоли гладких мышц матки. Потеря ATRX была обнаружена при некоторых типах лейомиосарком, редкого вида рака матки.
• Приобретённый миелодиспластический синдром альфа-талассемии (МДС) – это редкое заболевание, развивающееся у людей с миелодиспластическими синдромами (группой заболеваний костного мозга). При МДС соматические мутации в гене ATRX могут привести к развитию альфа-талассемии – заболевания крови, нарушающего выработку гемоглобина.
• Феохромоцитома и параганглиома — потеря ATRX наблюдается в некоторых из этих редких опухолей, которые возникают из клеток надпочечников или близлежащих нервов.
• Другие виды рака: мутации ATRX также были зарегистрированы в небольшом количестве опухолей лёгких, предстательной железы, поджелудочной железы и сарком. Значимость потери ATRX при этих опухолях ещё предстоит изучить.

Почему ATRX важен в патологоанатомическом заключении?

Патологоанатомы используют отсутствие экспрессии ATRX для диагностики и классификации некоторых опухолей, в частности, опухолей головного мозга, таких как астроцитомы и глиобластомы. Отсутствие ATRX в опухоли может указывать на наличие генетической мутации в гене ATRX.

При глиомах потеря гена ATRX часто сочетается с результатами других тестов, таких как статус мутации IDH и коделеция 1p/19q, чтобы подтвердить тип опухоли и определить тактику лечения.

При нейробластоме и нейроэндокринных опухолях поджелудочной железы мутации ATRX могут влиять на прогноз и открывать возможности для таргетной терапии, которая использует нарушенную способность раковых клеток восстанавливать ДНК.

Вопросы к врачу

• Был ли проведен анализ ATRX на моей опухоли?
• Что означают результаты теста ATRX для моего диагноза или лечения?
• Влияет ли наличие или отсутствие ATRX на мой прогноз?
• Может ли анализ ATRX указать на наличие генетического заболевания в моей семье?
• Стоит ли мне или членам моей семьи рассмотреть возможность генетического консультирования или дальнейшего обследования?