Frequenza allelica variante: definizione

La frequenza dell'allele variante (VAF) è una misura utilizzata nei test genetici sui tumori. Descrive la frequenza di una specifica alterazione genetica all'interno di un campione di tessuto analizzato e viene solitamente espressa in percentuale.

I tumori vengono spesso testati per rilevare alterazioni genetiche perché queste possono spiegare perché si è sviluppato un cancro, come potrebbe comportarsi e quali trattamenti potrebbero essere più efficaci. Un'alterazione genetica è chiamata variante e la maggior parte delle cellule normalmente presenta due copie (alleli) di ciascun gene. La frequenza degli alleli varianti indica ai medici quale proporzione di quelle copie geniche porta la variante.

Ad esempio, un VAF del 50% significa che circa la metà delle copie di DNA testate contiene la modifica genetica, mentre un VAF del 10% significa che la modifica è presente in un numero inferiore di cellule.

Perché la frequenza delle varianti alleliche è importante?

La frequenza delle varianti alleliche aiuta i medici a comprendere quanto sia diffusa una modifica genetica all'interno di un tumore.

Un VAF più elevato indica solitamente che la variante è presente in molte cellule tumorali. Ciò potrebbe suggerire che il cambiamento si è verificato in una fase precoce dello sviluppo del tumore o che svolge un ruolo importante nella sua crescita.

Un VAF inferiore indica che la variante è presente in un numero inferiore di cellule. Questo può accadere quando un tumore contiene un mix di diverse popolazioni cellulari, quando la mutazione si è sviluppata in un secondo momento o quando il campione include sia cellule tumorali che cellule normali.

Anche le varianti con un VAF basso possono essere significative, soprattutto se influenzano le decisioni terapeutiche.

Come si misura la frequenza degli alleli varianti?

La frequenza dell'allele variante viene misurata mediante test molecolari, il più comune dei quali è il sequenziamento di nuova generazione (NGS) . Questi test analizzano da migliaia a milioni di frammenti di DNA e contano quanti contengono la variante rispetto a quanti non la contengono.

Poiché questi test sono altamente sensibili, possono rilevare cambiamenti genetici anche quando presenti solo in una piccola frazione di cellule.

La frequenza delle varianti alleliche indica quanto è aggressivo un cancro?

No. La frequenza degli alleli varianti non misura di per sé le dimensioni del tumore, lo stadio del cancro o l'aggressività. Fornisce invece informazioni sulla frequenza di una mutazione genetica nel campione analizzato.

I medici interpretano sempre la VAF insieme al tipo di tumore, ai risultati patologici, ai risultati delle immagini diagnostiche e alla storia clinica.

La frequenza degli alleli varianti indica se un cambiamento genetico è ereditario?

Non da sola. La frequenza delle varianti alleliche non può determinare in modo affidabile se una modifica genetica è ereditaria o si sviluppa solo nel tumore.

In alcuni casi, un VAF vicino al 50% nel tessuto non tumorale può suggerire una variante ereditaria, ma sono necessari ulteriori test per confermarlo.

La frequenza delle varianti alleliche può cambiare nel tempo?

Sì. La frequenza degli alleli varianti può variare con la crescita del tumore, la risposta al trattamento o lo sviluppo di nuovi gruppi di cellule tumorali. Per questo motivo, test ripetuti possono talvolta mostrare valori VAF diversi nel tempo.

Perché la frequenza delle varianti alleliche potrebbe essere inclusa nel mio referto patologico?

La frequenza delle varianti alleliche è inclusa per aiutare i medici a comprendere quanto sia rilevante una modifica genetica nel tumore. Queste informazioni possono aiutare a orientare le decisioni terapeutiche, spiegare il comportamento del tumore e supportare i test di follow-up quando necessario.

Domande da porre al medico

• Quali alterazioni genetiche sono state riscontrate nel mio tumore?

• Qual è la frequenza allelica variante per tali cambiamenti?

• Il VAF influisce sulle mie opzioni terapeutiche?

• Questa modifica genetica potrebbe essere ereditaria?

• Saranno necessari test ripetuti in futuro?